Korean Collection for Type Cultures

KCTC에서 제공하는 정보 및 문의 게시판 입니다.

Board

열린광장

QnA

분양 균주 16S sequencing 관련
작성자	immunobiome	조회수:116	2023-09-19
질문구분	혐기성세균	E-Mail	**********
분양번호 74411로 Clostridium butyricum KCTC1871 분양을 받았습니다. 해당 균주를 불리기 위해 2~3번 계대배양 후 glycerol stock으로 저장하였으며, 이를 사용하기 위해 cosmogentech사에 16S rRNA sequencing을 의뢰하였습니다. 27F 및 1492R primer를 이용하여 sequencing을 한 결과, 1492R로 읽은 서열이 자꾸 mix가 뜨는 현상이 발생하였습니다. 처음에 KCTC로부터 받은 powder를 DW에 현탁 후 보관하고 있었으며 이 또한 분석을 맡겼는데 역시 1492R로 읽었을 때만 mix가 떴습니다. 혹시 KCTC에서도 이 균주를 sequencing 맡기시면 Reverse primer로 읽은 부분에서 mix 현상이 뜨는지, 또한 16s sequencing때 어떤 프라이머를 사용하는지 문의드립니다. 감사합니다.

Address : (56212) 전라북도 정읍시 입신길 181 (신정동) 한국생명공학연구원 전북분원 생물자원센터
대전광역시 유성구 과학로 125 한국생명공학연구원 | 사업자등록번호 314-82-06063 | 대표:권석윤
※ 홈페이지 이용에 불편을 겪으실 경우 연락주세요. 최선을 다해서 도움을 드리겠습니다. (분양 문의. 063-570-5603 / 전산 관련. 063-570-5662)
※ 자원 관련 문의 사항 → 자원 담당자 별 안내 바로가기