Korean Collection for Type Cultures

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Akkermansia 균주 동정관련 문의
작성자	rangesung	조회수:266	2023-12-12
질문구분	혐기성세균	E-Mail	**********
안녕하세요. Akkermansia muciniphila 균주를 분양받았습니다. 그런데 해당 균주의 16S rRNA 염기서열을 확인하기 위해 785F, 907R set로 시퀀싱을 진행했더니, 할 때마다 785F 프라이머로 읽은 부분은 시퀀싱 피크가 mix되어 나타나거나 프라이머가 잘 붙지 않습니다.. 그래서 518F, 800R set로 시퀀싱을 진행했을 때에는 나름 깨끗하게 피크가 나오는 것같더라구요. 이 부분에 대해서 학술적으로 왜 그런지 답변이 가능할까요?? 제가 알기로는 다른 A. muciniphila 균주들 중에서도 16S rRNA 동정시 785F 프라이머를 도입하기에 시퀀싱 퀄리티가 좋지 못한 것들이 있다고 들었습니다. 답변 부탁드립니다. 감사합니다.

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